Dein Problem ist bekannt:
Du darfst deine Tiere nicht so "rumstehen" lassen. Es kann passieren dass sie sich dort hinstellen (oder hingestellt werden) wo ein Stein spawnen würde. Wenn das der Fall ist wird das Tier gelöscht und der Stein hingestellt. Ähnlich bei Bäumen aber nicht bei Büschen. Das kommt natürlich vermehrt bei Ankylos vor da diese ja dort stehen bleiben wo man gefarmt hat. Auch Kugeln automatisch auf Sammeln zu schicken kann verheerend sein da sie im schlimmsten Fall ja dort stehen bleiben wo sie den letzen Stein abgebaut haben und somit Voll sind.
Es gibt einen Mod (evtl kann mal jemand einen Link schicken?) wo man ein Iteam Craften kann was dir Quassie eine Navigation zu all deinen nicht mehr in der Base befindlichen Tieren gibt.